Daha sonra A Takım'a yükselen Murat Bölükbaşı, buradan Trabzonspor'a transfer oldu. 2009-2002 yılları arasında 17 maçta Bordo Mavili formayı giyen Murat 3 kez rakip fileleri havalandırdı. 2001-2002 sezonunda Akçaabat Sebatspor'a kiralanan futbolcu daha sonra çok sayıda takımda görev aldı.<br /> <br /> Akçaabat Sebatspor dışında Adanaspor, Sakaryaspor, Elazığspor, Boluspor, Altay, Ofspor, Karabükspor, İskenderun Demirçelikspor, Çorumspor'da oynayan Murat Bölükbaşı, toplam 251 lig maçında 83 kez fileleri havalandırdı.